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RhoGEF2 and the formin Dia control the formation of the furrow canal by directed actin assembly during Drosophila cellularisation. Development 132, 1009- (2005) Journal club で T さんが紹介。Membrane control のモデルシステムのひとつである…
Preferential adhesion mediated by Hibris and Roughest regulates morphogenesis and patterning in the Drosophila eye. Dev. Cell 8, 925- (2005) Journal club より S さんの紹介。Drosophila eye disc において、ommatidia は photoreceptor と、レン…
par-1, a gene required for establishing polarity in C. elegans embryos, encodes a putative Ser/Thr kinase that is asymmetrically distributed. Cell 81, 611- (1995) 細胞極性についての知識が将来的に効いていきそうな気がするので芸の肥やし的にお…
A structural basis for allosteric control of DNA recombination by lamda integrase. Nature 435 1059- (2005) 部位特異的 DNA 組み換えが起きるときの、この反応を触媒する lamda integrase と DNA のトポロジーを x-ray 結晶解析法で見ている。クローニ…
Dynamics of the basement membrane in invasive epithelial clusters in Drosophila. Development 132, 3069 (2005) 今日中に読んでしまおう。 Flytrap, a database documenting a GFP protein-trap insertion screen in Drosophila melanogaster. Nucleic …
Tea4p links microtubule plus ends with the formin for3p in the establishment of cell polarity. Dev. Cell. 8, 479- (2005) ひさしぶりの論文取り上げ。といっても細胞生物学会でこの話しも聞いていたんだけど。。。骨格セミナーでも T さんが取り上げ…
C. elegans daf-6 encodes a Patched-related protein required for lumen formation. Dev. Cell. 8, 893- (2005) 未読リストが更新されない。。。正確には未読ファイルが増えていく。。。
Enhancement of cellular memory by reducing stochastic transitions. Nature 435, 228- (2005) Y さんの論文セミナーから。システムバイオロジーの今後を占う仕事だとかで、あるネットワークの因子が同定されて、因子間の関係が記述された後に、システムの…
Global divergence of microbial genome sequences mediated by propagating fronts. PNAS 102, 7332- (2005) ちょっと重いんですが、バクテリアのゲノムの多様性を生みだしうる中立的な変異の安定化の機転となるものとして HGT (Horizontal Gene Transfer) …
面白そうなのが２報。メモ The golgin Lava lamp mediates dynein-based Golgi movements during Drosophila cellularization. Nat. Cell. Biol. 7, 612- (2005) The Diaphanous-related formin dDia2 is required for the formation and maintenance of fil…
Clips and Clasps and celluar dynamics. Nat. Reviews Mol. Biol. 6, 487- (2005) メモ。微小管のプラス端結合タンパク質と細胞運動制御のレビュー。
YM さん担当で EMT (Epithelial to Mesenchymal Transition) のメカニズムに迫っている Science の論文紹介から。 Regulation of the polarity protein Par6 by TGFbeta receptors controls epithelial cell plasticity. Science 307, 1603- (2005) 上皮が上…
Highly efficient endogenous human gene correction using designed zinc-finger nucleases. Nature 435, 646-651 (2005) 相同組み換えによるゲノム編集はその効率の低さ、あるいは組み換え率の配列依存性によって信頼度がそれほど高くなかった。この問題に…
Interchromosomal associations between alternatively expressed loci. Nature 435, 637-645 (2005) 予想はされていたがかなりショッキングな内容の論文が Nature に出てる。 T cell という白血球の一種は Helper type 1 と type 2 に分化することが知られ…
The apical determinants aPKC and dPatj regulated Frizzled-dependent planar cell polarity in the Drosophila eye. Cell 121, 621-631 (2005) Planar cell polarity (PCP, 平面細胞極性) は多細胞生物で広くみられる上皮細胞の性質であり、apical/basal …
Dynein light chain 1 regulates dynamin mediated f-actin assembly during sperm individualization in Drosophila. MBC advanced on-line publication 10.1091/mbc.E05-02-0103 (2005) Drosophila の精子形成過程も細胞骨格制御などの細胞生物学のモデル…
LIN-23 mediated degradation of beta-catenin regulates the abundance of GLR-1 glutamate receptors in the ventral nerve cord of C. elegans. Neuron 46, 51- (2005) Glutamate receptor の GFP fusion protein を GLR-1 (Glutamate receptor) エンハン…
HSV trafficking and development of gene therapy vectors with applications in the nervous system. Gene Therapy 12, 891-901 (2005) 先日とあるところでどの程度までゲノム操作を用いた遺伝子治療が現時点で可能なのかというシリアスな質問を聞いていた…
さっと目を通す。 Systematic discovery of regulatory motifs in human promoters and 3' UTRs by comparison of several mammals. Nature 434, 338- (2005) Comparative analysis of dioxin response elements in human, mouse and rat genomic sequences.…
WD40リピートを持つ、アクチンと微小管の架橋タンパク質（Drosophila and yeast）であり、アクチン制御因子（Mammal and Dictyostelium）でもある。変異体の表現型は、異常な細胞分裂や morphogen gradient の異常など興味深いものがある。メモ。 Dpod1, Dco…
Wnt signaling through Dishevelled, Rac and JNK regulates dentritic development. Nat. Neuro. 8, 34- (2005) 本日お誕生日の S さんの細胞骨格セミナー。見学者多数でいつもと若干雰囲気が違ったらしい。しかし、上述の理由により欠席。ああもったいない…
なんだか、不思議な論文。Clathrin はエンドサイトーシスなどで、膜を包み込むためのコートとしてはたらくタンパク質で、metaphase では不活化していると考えられてきた。しかし、Clathrin と GFP の融合タンパク質の挙動をよく観察してみると紡錘体に局在し…
Houchmandzadeh B, Wieschaus E, Leibler S. Establishment of developmental precision and proportions in the early Drosophila embryo. Nature. 2002 Feb 14;415(6873):798-802. Lucchetta EM, Lee JH, Fu LA, Patel NH, Ismagilov RF. Dynamics of Dros…
Systematic interpretation of genetic interactions using protein networks. Nat. Biotechnol 23, 561- (2005) Epistatis analysis with global transcriptional phenotypes. Nat Genetics 37 471- (2005) Computer simulations and image processing reve…
