Ciliogenesis defects in embryos lacking inturned or fuzzy function are associated with failure of planar cell polarity and Hedgehog signaling. メモのみ。精読リストへ。

Hrs regulates endosome membrane invagination and tyrosine kinase receptor signaling in Drosophila. 2002 年の Cell 誌から。Hrs (Hepatocyte growth factor-regulated tyrosine kinase substrate) の解析 Point mutation でアミノ酸置換の変異体を使っ…

Blog 熱が冷めてしまったわけではなく、懸案事項に時間を投入していたのでしばらくご無沙汰になってしまいました。そろそろ output していきましょう。 Fly genetics, S2 cell work, IHC, WB, Live imaging (Vivo & Vitro). あと三ヶ月もすれば今手持ちのツ…

どうも体調に変調を来している模様。睡眠を体が欲しているみたいだ。今日は黄檗まで出向。 Prediction of interfaces for oligomerizations of G-protein coupled receptors. の first author の話を直に聞ける機会があり、もう一方の演者の方の話もあり、今…

活動ログを開始。意味があるかどうかわかんないけど、健康の目安にはなるかな。

悩ましい...。二次抗体の組み合わせにしばし困惑。Drosophila embryo は、どうも CFP のチャネルに自家蛍光があるようなので使えない。で、YFP はおそらく anti-GFP とクロスするでしょう。しかも GFP と YFP の見切りは分光してもできなかったし*1。そうす…

だいぶご無沙汰です。多少お疲れ気味らしい。 ソフトは以下のサイトから GPL で。 http://www.cs.helsinki.fi/u/kpalin/EEL/ 原著はこちら Genome-wide Prediction of Mammalian Enhancers Based on Analysis of Transcription-Factor Binding Affinity しっ…

夜な夜な読み進んでいる。どちらもおすすめできるシリーズ。自分としてはベストセラー作家に対して斜に構えていた傾向があるのだが、このふたつを読んで意識が変わった。犯罪にかかわる人間の心理の描写がとても細かく、実際はどうか知らないが、思いもよら…

ひとまとめするためにどうしても必要な実験がいくつか。 Live imaging に訴えずともできる実験なので、いくつか IHC をしよう。 文献サーチ -> レファランスへ流し込み。

お隣の T さんにおすすめされたシリーズの第二弾。DVD で字幕もえいごだけど、なんとなくわかる。ワイン飲んでみようかなと思わせるような表現が多くてちょっと興味が湧いた。脚本がオトナな感じでそろそろこういうものを堪能できるようにならないといけない…

Leucine-rich repeat のコンセンサスは以下の 24 aa からなる: xLxxLxLxxNxIxxLpxxxFxxLx 膜にアンカーされるタイプでは N-flanking CPxxCxCxxxxxxC C-flanking PxxCxC(x20)C(x20)C のふたつの flanking region が LRR の前後に存在する。 Slit/Robo も同じ…

Glyoxalase 1 and glutathione reductase 1 regulate anxiety in mice. 少し前の Nature 誌から。純系統のマウスを用いて、不安や神経症に関与する遺伝子を探している。まず、行動に関するテストをいくつか。明るい箱と暗い箱を用意して、どちらにいる時間が…

機能解析シリーズ 機能解析用コンストラクト 変異体 準備はできたけど、結果が出せる状態に整うのは多分2月中。 Live imaging FRAP アッセイ MT plus end tracker の定量 んで、もうひとつの遺伝子の破壊。と、あとは candidate approach...。Enhancer も。

森博嗣の戦闘機パイロットシリーズ1,2 。 どうも三作目から読んだような気がするが、あまり関係ないのでシリーズものと言えるのかどうか微妙。空想の世界へ飛んでいけるので、読み物として余暇にちょうどいいかも。ただそれほどお勧めできない。気分転換には…

Raised plasma nerve growth factor levels associated with early-stage romantic love.せっかく読んで紹介まで某所でしたのでちょろっとメモ。そして情報ソースへのリンク。 Are you in love with anyone right now? 好きな人のことを４時間想う。 どちら…

師匠と話していると足りない気がする。見えている現象からどんな考察ができるか、という過程が一番楽しいはずなのでよく考えよう。

眠れるラプンツェル (幻冬舎文庫) プログレス前。なんとなく夜な夜な読んでしまった。ラプンツェルの方は読んでいてつらい感じ。もう少しカタルシスが欲しい。ブルーの方は設定があり得ないだけに楽しく読めた。どうも妙にリアリティのある小説はだめみたい…

非常に都合のいいとれ方をした。多分これ以上を望むのは難しいのではないかと思う。First Met を欠損しているので翻訳開始地点が大幅*1に 3' 側へずれこみ、機能ドメインを失っている。染色と Western blot と RT-PCR で発現をチェックして本番の解析へ持ち…

染色が終わる時間が夕方になるので、そこから観察を始めるとテンションが上がってくる。「死体写真」と言われても、多重染色を行うことで得られてくる情報とそこからわき上がるイマジネーションの意味は大きい。しばらく固定/染色/観察が続く。最近研究ネタ…

結局プライマーの問題が浮き彫りになり、再合成品を使うことに。 このくらい晴れやかだと気分がいいんだけど。

夏の間短いので定着していたけど、ちょっとのばして今日カット。通りがかりの先月オープンのお店。青リンゴの香りのするワックスをプレゼントしてもらう。今日はあと DNA いじりと live imaging と IHC。いつもと一緒。

Artificial cell-cell communication in yeast Saccharomyces cerevisiae using signaling elements from Arabidopsis thaliana. Arabidopsis のリガンドとレセプターを cerevisiae に組み込み、下流の遺伝子の応答を制御するという話。なぜか、 cerevisiae …

Distinct roles for two receptor tyrosine kinases in epithelial branching morphogenesis in Drosophila. 商売敵その2 *1。解析に使ってるエフェクターもほとんど一緒だし、前回 piopioの論文 で使っていた mRFP-moesin がまた登場している。どうしても G…

北海道システム・サイエンスにオリゴ DNA 合成の依頼をしている。遺伝子に point mutation を入れるため、inverse PCR で３種類の変異遺伝子を作成していた。その３種類のうちふたつに関してはシークエンスを読んだ 5 クローンすべて目的の変異が入っていた…

検出系に目的のものと思われるバンドが現れた。年末ジャンボ路線のあたり。確認実験しなきゃ。

dna 11という会社はクライアントの DNA をもとにゲノムの制限酵素地図 ? やデュアルカラーサザンブロット ? などの写真を販売してるらしい。こんなの部屋にあったらかなり落ち着かないだろうな。

Dominant marker の使い方は実際なかなかわからない。もうキャリアはだけはのびていくのだが、バランサー染色体の Visible marker 以外の Green marker とか lacZ marker の stage による使い分けに実際どれを使えばいいとか (abdA-lacZ は late embryonic s…

DNA work, Embryo fix and IHC (quite a few combination...) -> Confocal, P-element jump out, transgenic balancing. 順調に進行中。年内にどこまで進むかな。Time lapse で見たいものが目白押し状態で、line の準備は整っているにもかかわらず手が回らな…

アメリカは４つあるらしい。野球中継を見ようとしても、住んでいる地域のホームゲーム以外はなかなか見られないし、そもそも放映されもしないことが多いらしい。まああれだけ大きな国だとそうなるのかもしれない。 一方同じくらい大きな中国は北京標準時のみ…